草魚呼腸孤病毒培養與滴度測定、及在草魚、CIK細胞上的生長特性研究(二)
1.3.3靈敏性試驗及標準曲線繪制對重組質粒10倍梯度稀釋后,進行熒光定量PCR擴增。參照SYBR Green熒光定量試劑盒說明書,分別取稀釋好的重組質粒1μL為模板進行PCR擴增。反應體系為:2×SYBR GreenⅠPCR反應混合液10μL,10 pmol/L的上、下游引物各1μL,加ddH2O補足20μL。反應采用三溫循環,程序為:95℃預變性10 s;95℃變性5 s,56℃退火30 s;72℃延伸15 s,40個循環,并收集熒光信號。
1.3.4特異性試驗分別取GCRV 873毒株、傳染性造血器官壞死癥病毒(IHNV)、鯉魚春季病毒血癥病毒(SVCV)核酸,以其為模板進行Realtime PCR擴增,20μL體系加模板1μL,并設立陰性對照。
1.4病毒培養與滴度測定
將保存于液氮中的GCRV 873毒株接種于長成致密單層的CIK細胞,28℃吸附1 h;吸棄病毒液,加入與培養液等量的維持液(含2%FBS的M199),28℃恒溫培養。每日觀察細胞形態,直至出現80%細胞病變,收取病毒液進行滴度測定。GCRV873的細胞培養液經反復凍融后作連續10倍梯度稀釋,取10-3~10-108個稀釋度,每個稀釋度取100μL的病毒液接種于96孔板上的單層CIK細胞;每稀釋度接種8孔,28℃孵育1 h后棄去,加入維持液繼續培養,并設正常細胞為對照,連續觀察7 d。根據病變情況,按Karber氏法計算半數組織培養感染劑量(TCID50)。lgTCID50=L+d(s?0.5)。式中:L為病毒最低稀釋度的對數,d為組距(稀釋系數),s為各組病變數與接種數比值之和。
1.5 GCRV 873株在CIK細胞上的生長特性研究
CIK細胞培養于24孔細胞板,待細胞長至致密單層時,棄去培養液,用1×104TCID50/mL,每孔100μL的GCRV 873毒株感染細胞。感染后分別于0、2、4、8、10、12、24、36、48、72 h收取病毒細胞培養液,應用建立的Real-time PCR方法檢測定各時間點的病毒RNA增殖情況,并通過對各個時間點病毒滴度的測定,檢測病毒拷貝數,同時分別顯微鏡觀察0、12、24、36、48、72 h的CIK病變情況。
1.6 GCRV 873株在草魚體內的生長特性研究
試驗魚用MS222溶液(1 mg/L)麻醉,每尾草魚腹腔注射TCID50為1×106的GCRV 0.1 mL,對照組每尾注射同等劑量的滅菌生理鹽水。于注射后1、2、3、5、7 d取樣,每組隨機選取4尾試驗魚,用MS222(1 mg/L)麻醉后,取其肝臟、脾臟、腎臟,用Trizol提取各組織RNA后反轉錄為cDNA,應用Real-time PCR方法測定肝臟、脾臟、腎臟中的病毒含量。
1.7數據分析
熒光定量PCR反應結束后,查看擴增曲線和Ct值等;通過標準曲線換算得到樣品中內參基因β-actin和病毒基因組的絕對拷貝數,再經β-actin校正得到相應的相對拷貝數。
2結果
2.1 Real-time PCR檢測方法的建立
用特異性熒光定量引物VP6-U/VP6-L對病毒核酸進行PCR擴增,將得到的產物進行瓊脂糖凝膠電泳分析,發現擴增片段與預期大?。?02 bp)一致,且特異性好(圖1)。將擴增片段克隆到pMD-18T后送測序,發現序列與Genebank上公布的序列一致。從不同稀釋度的標準品Real-time PCR擴增反應(圖2)可以看出,從1×101~1×106個拷貝數的質粒擴增曲線均呈“S”型,且與指數增長期的擴增曲線平行,反映出PCR的擴增效率相近,檢測靈敏度為1×101個病毒粒子。以質粒拷貝數的對數為X軸,以Ct值為Y軸,根據兩者的相關性得到標準曲線Y=3.237×log(X)+39.63,其相關系數R2為0.999,擴增效率為103.7%。特異性試驗結果顯示(圖3),GCRV病毒核酸擴增曲線呈“S”型,而IHNV、SVCV及陰性對照均沒有擴增曲線,說明所建立的檢測方法特異性好。
圖1引物VP6-U、VP6-L PCR擴增結果
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